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SCIEX Triple TOF系统上的SWATH采集技术(二)
发表时间:2023/12/21 10:31:24  |  点击率:820

检测低丰度分析物,在复杂样品中

样品越复杂,质谱系统越难对低丰度分析物进行鉴定和定量分析。SWATH采集技术由TripleTOF技术提供支持,可找到所有可检测的物质,无论它们的浓度高低。

检测复杂样品中的低丰度化合物充满挑战,即使对于如今功能强大的MS分析仪来说也是如此。MS谱中的干扰会导致检测低含量分析物面临困难,即使使用高分辨率系统也无法解决问题。同时,高含量分析物会占用质谱仪的大量周期时间(MS/MS一般按强度顺序采集),没有时间捕捉与低含量分析物有关的MS/MS信息。要解决这个问题,需要在以下技术性能之间建立重要的相互关系:Q1采集窗口控制和在高速下保证MS/MS采集分辨率。

关键技术标准1:可变窗口采集

SCIEX SWATH 采集技术由可变窗口采集提供支持。通过使用可以调整 Q1 隔离窗大小的控件,您可以在样品密度高的 m/z 区域(预期有大数量的化合物和分析物的区域)利用更小的Q1 m/z 窗口。这样一来,专一性会更高,从而能够捕捉与样品相关的更深入信息,降低漏掉复杂样品中低丰度峰的风险。

以蛋白质组学样品为例
大量肽的质量范围介于500-800 m/z 之间。使用可变窗口采集,您可以在此质量范围内利用更小的 Q1 SWATH 窗口(在此密集样品区域中覆盖更多的峰),然后在其他质量范围内使用更宽的窗口。总之,此策略可为您提供全面的分析物覆盖,并且可以进一步检测样品中的低丰度化合物。

关键技术标准2:在高速下保证MS/MS分辨率

如前所述,复杂样品会占用质谱仪宝贵的扫描时间,导致系统只能有足够的时间捕捉样品中含量更多的分析物的 MS/MS 信息,而这些分析物可能并不是您要分析的物质。在利用数据依赖型采集策略时,低丰度化合物中检测的峰甚至可能不会触发 MS/MS 采集,而这种采集对化合物鉴定至关重要。

借助 TripleTOF6600 SWATH采集技术每秒多可采集 100 MS/MS 谱图,同时不会降低光谱分辨率,从而提供更高数量的 Q1 窗口。这样不仅可以更好地检测低含量分析物,重要的是,还可以利用每份样品完成更多的化合物鉴定和定量分析。

 

首次分析时可捕捉样品完整的数字档案

停止储存样品,开始储存数据。只需分析一次,SWATH采集技术就可以收集所需要的与样品相关的所有数据。如果分析事件至关重要、无法重复分析、样品数据有限或样品可能会讲解,这种技术的优势就更为明显。

作为非数据依赖型采集策略,SWATH采集技术可以在所有可检测峰上采集MSMS/MS信息—如果以后出现新问题,只需重新查询样品数据即可

 

对分析物进行定量分析

高质量、高专一性定量分析的核心在于出色的MS/MS灵敏度、宽动态范围和非凡重现性。SWATH采集技术采用SCIEX TripleTOF技术,可提供上述三种优势。

通常,不仅仅是样品的成分十分重要,样品中成分的"含量"对我们得出的结论或制定决策也很关键。SWATH采集技术是一种非数据依赖型策略,拥有其他技术所不具备的功能。从使用高分辨率MS/MS数据(通过MS)提供深度高一个数量级的定量覆盖,到经过验证的样品间重现性,SWATH采集可以提供可靠的定量结果,从而推进研究,达到标准的MRM定量分析策略水平。

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