色谱仪中色谱柱的温度，不仅影响色谱过程的热力学因素，也影响传质过程的动力学因素。柱温变化，不仅影响柱前端压力、载气流速等，更重要的是对物质的分离、分析结果带来影响
　　气相色谱中，柱温是影响化合物保留时间的重要因素。使用中，应注意柱温的选择，因为柱温关系到：色谱柱固定液的寿命。若柱温高于固定液的较高使用温度，则会造成固定液随载气流失，不但影响柱的寿命，而且固定液随载气进入检测器，将污染检测器，影响分析结果。
　　柱温变化对二手安捷伦气相色谱仪的分析结果有重要的影响，选择合适的柱温以及对柱温进行控制就很重要了。
　　应保证柱温不高于固定液的较高使用温度(即色谱柱的高耐受温度)，避免固定液流失而影响色谱柱柱效和使用寿命；
　　选择合适的柱温，柱温的选择应使难分离的两组分达到预期的分离效果，峰形正常而分析时间又不长为宜，一般柱温应比试样中各组分的平均沸点低20-30℃，通过试验决定；
　　对于沸点范围较宽的试样，应采用程序升温，按预定的加热速度随时间呈线性或非线性地增加温度。一般升温速度是呈线性的。
　　化合物保留时间。柱温越高，出峰越快，保留时间变小。柱温变化会造成保留时间的重现性不好，从而影响样品组分的定性结果。一般柱温变化1℃，组分的保留时间变化5%，如果柱温度变化5%，则组分的保留时间变化20%。
　　分离效能和分析时间。若柱温过高了，会使各组分的分配系数K值变小，分离度减小;但柱温过低，传质速率显著降低，柱效能下降，而且会延长分析时间。
　　色谱峰峰形。柱温升高，正常情况下会导致半峰宽变窄，峰高变高，峰面积不变。但是组分峰高变高，以峰高进行定量时时分析结果可能产生变化;反之柱温降低，则相反。
　　当采用纯样叠加法定性时，已知混合物中含某组分，将该组分的纯样加入，观察加入前后的响应信号变化。柱温变化，保留时间变化，但是加入前后的样品影响信号变化是一致的，因此柱温变化不影响采用这种方法定性的结果。
　　当二手安捷伦气相色谱仪采用保留指数定性时，恒温分析，保留指数与保留时间有关，而柱温影响保留时间变化;程序升温分析，除了保留时间，保留指数还与保留温度有关。因此，这种定性方法易受柱温变化影响。