液质联用气体的选用根据区域不同，气体作用不同，选用的气体自然不同。

一，离子源区和离子传输区，这个区域使用的气体就是帮助离子化的。气体当然是选惰性的为佳。但是，选氦气、氩气太贵，所以，大家都会选用氮气，虽然它不是完全惰性，只是帮助离子化，氮气足够了。这时的氮气一般有三种作用，

（1）第一种是帮助离子化的辅助气（Auxillary gas），它是最常使用的。使用流速参见各公司说明，一般来说，液相流量大，就要求辅助气流速大。非常关键的一点，ESI的流速开得大，灵敏度反而会降低。

（2）第二种作用是用于抵抗污染的，比如AB叫帘气（Curtain gas），Thermo叫吹扫气（Sweep gas），Agilent叫反吹气。这路气体可以不开，对脏样品管用，对干净样品反而会降低灵敏度。

（3）第三种，是为了加热（不包括每种仪器）。加热也是为了提高离子化效率。Waters的仪器以及Thermo的大部分仪器都可以加热离子源框架，或者离子传输管，所以不再加热气体。但是，AB的Turbo源、Thermo的H-ESI源，都是在喷针旁边在用氮气流加热，为的是提高离子化效率。Agilent/Bruker的仪器对喷针不加热，但是它的离子传输管不能直接用电路加热，所以在传输管外侧就用热氮气流加热。值得注意的是：这种加热气体的设计，会导致仪器耗气量急剧增加（气体加热了以后挥发更快）。

二，离子经过离子源区、和离子传输系统，完成了离子化，就进入真空的分析区。这个区域要求用绝对的惰性气体，以完成碰撞，因为如果还用氮气，会碰出很多“鬼峰”。

最先的考虑用氩气，因为氩气比氦气便宜。液质联用：串联四极杆、Q-TOF都是用氩气的。

但是，在离子阱的最初设计时，人们发现，氦气还有一种奇妙的作用，它可以缓释动能，因为离子刚刚进入离子阱中动能很大，很容易碰在阱壁上就“湮没”了，而充入一定的氦气，刚好可以缓释动能，使离子快速稳定在阱的中央，这种气体叫做“damping gas”。所以，在离子阱中选用氦气可谓一举两得，既缓释了离子动能，又做了碰撞气。

三，液质联用离子源区的气体不见得非要用高纯的氮气，很多用户都用普氮。不过，用普氮，过一段时间气体接入质谱的地方（比如滤膜等）会脏，要常检查常清洗、更换，否则就把仪器污染了。分析区的氦气或氩气要用高纯的。